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EPIYA motif patterns among Cuban Helicobacter pylori CagA positive strains Patrón de los motivos EPIYA de cepas cubanas de Helicobacter pylori CagA-positivas

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Author(s): Lino E. Torres | Lidice González | Karelia Melián | Jordis Alonso | Arlenis Moreno | Mayrín Hernández | Orlando Reyes | Ludisleydis Bermúdez | Javier Campos | Guillermo Pérez-Pérez | Boris L. Rodríguez

Journal: Biomédica
ISSN 0120-4157

Volume: 32;
Issue: 1;
Date: 2011;
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ABSTRACT
Introduction. It is known that polymorphisms in C-terminal region of CagA influence gastric disease development on Helicobacter pylori infection. Additionally, the geographic distribution of these polymorphisms has been associated with the appearance of more severe gastroduodenal pathologies.Objective. To determine the CagA phosphorylation motifs pattern (EPIYA pattern) in Cuban H. pylori isolates, and to study its association with patient's pathologies. Materials and methods. DNAs from 95 H. pylori cagA-positive strains were used to amplify the 3' variable region of cagA gene by PCR using two different strategies. Additionally, new primers were designed to identify either Western or Eastern CagA EPIYA motif type by PCR. To confirm the PCR results, PCR products from 14 representative isolates were purified and sequencedResults. The distribution of the EPIYA motif found was: 2 AB (2.1 %), 1 AC (1.1 %), 1 BC (1.1 %), 70 ABC (73.6 %), 19 ABCC (20 %), and 2 ABCCC (2.1 %). Sequencing analysis confirmed the PCR classification in the 14 studied strains and showed three strains with unusual nucleotide sequences, not reported before. Distribution of the EPIYA-ABC pattern was equivalent in all pathologies (78.9 % in gastric ulcer, 72.5 % in duodenal ulcer and 72.2 % in non-ulcer dyspepsia).Conclusion. The PCR results using the new primers confirmed that all studied strains carried the Western CagA type. No specific EPIYA motif was associated with peptic ulcer. This is the first report that shows EPIYA motif distribution in H. pylori isolates from the Caribbean region.Introducción. Se conoce que el polimorfismo en la región C-terminal de CagA influye en el desarrollo de la enfermedad gástrica durante la infección por Helicobacter pylori. Objetivo. Determinar el número y tipo de patrones de fosforilación de CagA (patrón EPIYA) en aislamientos cubanos de H. pylori, y estudiar su asociación con las patologías gástricas.Materiales y métodos. Los ADNs de 95 cepas de H. pylori cagA-positivas, fueron empleados para amplificar la región 3' variable del gen cagA por PCR mediante el empleo de diferentes estrategias. Se diseñaron además nuevos cebadores para clasificar los aislados según el tipo occidental o del este asiático de CagA por PCR. Los productos de PCR obtenidos de 14 aislados representativos fueron purificados y secuenciados para confirmar los resultados del PCR.Resultados. La distribución de los patrones EPIYA encontrada fue: 2 AB (2,1%), 1 AC (1,1%), 1 BC (1,1%), 70 ABC (73,6%), 19 ABCC (20%), y 2 ABCCC (2,1%). El análisis de la secuenciación confirmó las clasificaciones realizadas por PCR en las 14 cepas estudiadas y mostró 3 cepas con secuencias nucleotídicas únicas, no reportadas anteriormente. La distribución del patrón EPIYA-ABC fue equivalente en todas la patologías encontradas (78,9 % en úlcera gástrica, 72,5 % en úlcera duodenal y 72,2 % en dispepsia no ulcerada).Conclusión. La mayoría de los aislados cubanos presentaron las combinaciones de motivos EPIYA menos virulentas (ABC). Los resultados del empleo de los nuevos cebadores y el análisis de la secuenciación confirmó que todas las cepas estudiadas portaban el CagA tipo occidental.

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