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Experimental error in AFLP markers: consequence and estimative
Erro experimental em marcadores AFLP: consequências e estimativas

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Author(s): Jefferson Luís Meirelles Coimbra | Altamir Frederico Guidolin | Maurício Marini Kopp | Juliano Garcia Bertoldo | Bruna Arruda | Jussara Cristina Stinghen

Journal: Semina : Ciências Agrárias
ISSN 1676-546X

Volume: 33;
Issue: 1;
Start page: 87;
Date: 2012;
Original page

Keywords: Oryza sativa L. | Coeficiente de dissimilaridade | Repetibilidade Mahalanobis.

ABSTRACT
The objective of this study was to estimate and to compare the Dice coefficients of dissimilarity through experimental error estimation, from the use of replications composed by plant bulks. The estimate of this coefficient can become more reliable and robust with the use of replications in the molecular analyses. This procedure favors either the tests of hypotheses or the evaluation of the contrasts of interest, according to the objective of the experiment. Also, to compare these estimates with each other and with the genetic dissimilarity estimate based on agronomical traits measured in the field. Among the evaluated variables (genetic and morphological), the distances estimated with base in the use of molecular versus morphological data evidenced 80% of agreement in the estimated values, compared to 5% (P < 0.05) when the replications were used, in the molecular analysis. This way, it is evident that the use of replications in molecular analyses, besides supplying an estimate of the experimental error, enables an immediate gain through the tests of hypotheses, increasing both the reliability of the estimates of the genetic parameters (i.e., repeatability), and the agreement between laboratory and field data.O objetivo deste trabalho foi estimar e comparar os coeficientes de dissimilaridades de DICE por meio da estimativa do erro experimental, proveniente da utilização de repetições, que foram compostas por bulks de plantas e, comparar tanto estas estimativas entre si e com a estimativa da dissimilaridade genética baseada em caracteres agronômicos avaliados por meio da experimentação a campo. A estimativa deste coeficiente pode se tornar mais confiável e robusta com a utilização de repetições nas análises moleculares. O uso de repetições em análises moleculares favorece tanto os testes de hipóteses quanto a avaliação dos contrastes de interesse. A associação entre as medidas avaliadas (genética e morfológica), com base na utilização de dados moleculares versus morfológicos evidenciou 80% de concordância nos valores estimados, (P < 0,05) quando foram utilizadas as repetições, na análise molecular. Desta forma, fica evidente que o emprego de repetições em análises moleculares, além de fornecer uma estimativa do erro experimental, propicia um ganho imediato por meio dos testes de hipóteses; podendo incrementar desta maneira tanto a confiabilidade das estimativas dos parâmetros genéticos, como por exemplo, a repetibilidade, quanto à concordância dos valores de laboratório e de experimentos de campo.
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